POPS

POPS est spécialisée dans l’analyse du transcriptome chez les végétaux. Elle offre une expertise pour l’analyse de l’expression comparative des gènes par l’utilisation du séquençage à haut débit de l’ARN, ou RNA-seq. Cette offre est complétée par l’analyse bio-informatique et statistique des données brutes permettant l’analyse quantitative du transcriptome.

Expertises et services :

• Analyse transcriptomique orientée ou non des ARNs polyadenylés (brin codant),
• Analyse des petits ARNs : miRNA, siRNA…
• Analyse orientée des ARNs non polyadenylés (déplétion),
• Microtranscriptomique ou séquençage de très faibles quantités d’ARN (à partir de 75 pg),
• Métatranscriptomique ou séquençage du transcriptome de plusieurs espèces à partir d’un même échantillon,
• Analyse d’empreintes,
• Analyse à l’échelle de la cellule unique,
• Séquençage long reads permettant un assemblage hybride de novo,
• Analyse bioinformatique et statistique des données générées,
• Soumission des données aux bases de données CATdb (base de données interne) et GEO (base de données internationale du NCBI).