IFB / BioinfOmics

BioinfOmics fédère et coordonne l’offre d’accompagnement et de services de 4 plateformes INRAE (Genotoul Bioinfo, Migale, PlantBioinfoPF, Sigenae) avec des compétences complémentaires en bioinformatique et biostatistique.

Cette e-infrastructure répond aux besoins en bioinformatique des sciences de la vie, dans un contexte de production massive de données et de science ouverte. L’un de ses objectifs consiste à relever les défis de la bioinformatique dans les domaines de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement pour une grande diversité d’espèces animales, de plantes et de microorganismes.

BioinfOmics constitue un acteur majeur au sein de l'infrastructure de recherche nationale de services en bioinformatique, l’IFB (Institut Français de Bioinformatique), qui mutualise, soutient et coordonne le développement des plateformes de bioinformatique dépendant d’organismes publics de recherche. Au travers de cette infrastructure nationale, BioInfomics a bénéficié de financements du programme "Investissements d'Avenir. L’IFB est également le nœud français de l’infrastructure Européenne de bioinformatique : ELIXIR. Des membres de BioinfOmics sont impliqués dans le comité de direction de l’IFB, dans des projets qu’il porte (PIA3 MuDiS4LS, ELIXIR-Converge, PPR ABRomics) et dans la coordination de plusieurs actions de l’IFB ou en lien avec celui-ci : les missions formation et guichet, la représentation de l’IFB dans d’autres infrastructures nationales (France Génomique), la liaison avec ELIXIR (deputy Head of Nodes, co-coordination ELIXIR plant community).

L’offre d’accompagnement de BioinfOmics intègre :

• l’hébergement de comptes utilisateurs/projets via la mise à disposition d'une infrastructure informatique de calcul et stockage à l’échelle, environnée et dédiée, des logiciels et banques généralistes et spécialisées du domaine, un support aux utilisateurs ;
• le développement et le déploiement de ressources innovantes telles que logiciels, banques de données et systèmes d’information ;
• un accompagnement à la valorisation de données “omiques” pour de nombreuses applications en génomique, en métagénomique autour des données issues du séquençage (assemblage et annotation de (méta)génomes, analyse de données (s)RNAseq, RNAseq de novo, methyl-seq,...), des services d’intégration de données en mobilisant des approches statistiques et/ou des environnements interopérables ;
• la diffusion d'un savoir-faire en bioinformatique à travers des cycles d’apprentissage, du tutorat, du conseil et de l'assistance aux utilisateurs.